2023-07-14 阅读数：8350
| 序号 | 级别 | 名称 | 批准年份 | 依托学院 |
| 1 | 校级 | 云南普洱茶研究院 | 2007 | 茶学院 |
| 2 | 校级 | 东方蜜蜂研究所 | 1992 | 动物科学技术学院 |
| 3 | 校级 | 动物遗传育种研究所 | 1995 | 动物科学技术学院 |
| 4 | 校级 | 云南农业大学生猪疫病研究中心 | 2018 | 动物医学院 |
| 5 | 校级 | 机械设计研究所 | 1993 | 机电工程学院 |
| 6 | 校级 | 云南农业大学特色经济作物生产装备研究中心 | 2018 | 机电工程学院 |
| 7 | 校级 | 云南农业大学城乡规划设计研究院 | 2011 | 建筑工程学院 |
| 8 | 校级 | 建筑工程检测中心 | 2006 | 建筑工程学院 |
| 9 | 校级 | 节能减排检测与研究工程中心 | 2010 | 建筑工程学院 |
| 10 | 校级 | 云南农业大学生物质新材料研究中心 | 2018 | 建筑工程学院 |
| 11 | 校级 | 云南生物制造研究院 | 2018 | 理学院 |
| 12 | 校级 | 稻作研究所 | 1985 | 农学与生物技术学院 |
| 13 | 校级 | 甘蔗研究所 | 1997 | 农学与生物技术学院 |
| 14 | 校级 | 薯类研究所 | 2000 | 农学与生物技术学院 |
| 15 | 校级 | 食用菌研究所 | 2000 | 农学与生物技术学院 |
| 16 | 校级 | 云南省中药材规范化种植技术指导中心 | 2006 | 农学与生物技术学院 |
| 17 | 校级 | 中药材研究所 | 2002 | 农学与生物技术学院 |
| 18 | 校级 | 云南农业大学特色小宗作物研究中心 | 2018 | 农学与生物技术学院 |
| 19 | 校级 | 云南种业创新研究院 | 2022 | 农学与生物技术学院等 |
| 20 | 校级 | 云南农业大学热区健康饮料研究中心 | 2018 | 热带作物学院 |
| 21 | 校级 | 辣木研究所 | 2014 | 食品科学技术学院 |
| 22 | 校级 | 水资源与节水灌溉重点实验室 | 2004 | 水利学院 |
| 23 | 校级 | 自然资源科学技术工程研究中心 | 2009 | 水利学院 |
| 24 | 校级 | 云南农业大学水科学与工程研究中心 | 2018 | 水利学院 |
| 25 | 校级 | 云南农业大学功能产品研究中心 | 2018 | 园林园艺学院 |
| 26 | 校级 | 花卉研究所 | 1994 | 园林园艺学院 |
| 27 | 校级 | 云南农业大学中国花文化研究院 | 2018 | 园林园艺学院 |
| 28 | 校级 | 生态环境研究所 | 2001 | 资源与环境学院 |
| 29 | 校级 | 土壤与肥料研究所 | 2002 | 资源与环境学院 |
| 30 | 校级 | 云南农业大学南亚东南亚农村发展研究院 | 2017 | 经济管理学院 |
| 31 | 校级 | 云南农业农村经济研究院 | 2018 | 经济管理学院 |
| 32 | 校级 | 生态文明研究中心 | 2017 | 人文社会科学学院 |
| 33 | 校级 | 科学技术史研究所 | 2001 | 马克思主义学院 |
| 34 | 校级 | 云南农业大学南亚东南亚政党研究中心 | 2017 | 马克思主义学院 |
| 35 | 校级 | 农村体育发展研究院 | 2018 | 体育学院 |
| 36 | 校级 | 农业教育研究所 | 1994 | 继续教育学院 |
| 37 | 校级 | 云南农业大学功能性菌肥开发研究中心 | 2023 | 农学与生物技术学院 |
| 38 | 校级 | 云南农业大学家禽疾病防控研究中心 | 2023 | 动物医学院 |
| 39 | 校级 | 云南农业大学绿色农药研发中心 | 2023 | 植物保护学院 |
| 40 | 校级 | 云南农业大学风景园林研究院 | 2023 | 园林园艺学院 |
| 41 | 校级 | 云南农业大学咖啡研究院 | 2023 | 食品科学技术学院、经济管理学院、热带作物学院 |
| 42 | 校级 | 云南农业大学生态岩土与水土保持工程中心 | 2023 | 水利学院 |
| 43 | 校级 | 云南农业大学农业节能减碳与废弃物综合利用研究中心 | 2023 | 机电工程学院 |
| 44 | 校级 | 云南农业大学农业化学研究中心 | 2023 | 理学院 |
| 45 | 校级 | 云南农业大学数智低碳建筑与全过程创新管理研究中心 | 2023 | 建筑工程学院 |
| 46 | 校级 | 云南农业大学农村社会工作研究中心 | 2023 | 人文社会科学学院 |
| 47 | 校级 | 云南农业大学农业多语应用研究基地 | 2023 | 外语学院 |
| 48 | 校级 | 云南农业大学运动智能创新应用研究中心 | 2023 | 体育学院、大数据学院 |
| 49 | 校级 | 云南农业大学热区农业大数据研究中心 | 2023 | 热带作物学院 |